Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r78K7N6U5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn2r78K7N6U5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn2r78K7N6U5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r78K7N6U5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms