Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21887J3QQ04 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm21887J3QQ04 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm21887J3QQ04 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm21887J3QQ04 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm21887J3QQ04 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm21887J3QQ04 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm21887J3QQ04 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm21887J3QQ04 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21887J3QQ04 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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