Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim55G3X8Y1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim55G3X8Y1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim55G3X8Y1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim55G3X8Y1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms