Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XntrpcF8VQM8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XntrpcF8VQM8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XntrpcF8VQM8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms