Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp72F8VQC1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp72F8VQC1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp72F8VQC1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms