Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ScaperF8VQ70 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ScaperF8VQ70 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ScaperF8VQ70 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms