Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8334F7CD45 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8334F7CD45 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8334F7CD45 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms