Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptar1E9QAB6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptar1E9QAB6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptar1E9QAB6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptar1E9QAB6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptar1E9QAB6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptar1E9QAB6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptar1E9QAB6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms