Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc7bE9Q9Y3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms