Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms