Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
1700024B05RikE9Q6D7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700024B05RikE9Q6D7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700024B05RikE9Q6D7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700024B05RikE9Q6D7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700024B05RikE9Q6D7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700024B05RikE9Q6D7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
1700024B05RikE9Q6D7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms