Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc85cE9Q6B2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc85cE9Q6B2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms