Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2010300C02RikE9Q3M9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
2010300C02RikE9Q3M9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2010300C02RikE9Q3M9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms