Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ift140E9PY46 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ift140E9PY46 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ift140E9PY46 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ift140E9PY46 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms