Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9008E9PVG0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm9008E9PVG0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm9008E9PVG0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm9008E9PVG0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm9008E9PVG0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm9008E9PVG0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm9008E9PVG0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm9008E9PVG0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm9008E9PVG0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm9008E9PVG0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm9008E9PVG0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms