Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc175E9PVB3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc175E9PVB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms