Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Piezo1E2JF22 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Piezo1E2JF22 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms