Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1330D3Z460 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1330D3Z460 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1330D3Z460 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1330D3Z460 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1330D3Z460 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm1330D3Z460 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm1330D3Z460 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm1330D3Z460 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1330D3Z460 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms