Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms