Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0J0

Defa34, Defensin, alpha, 34, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa34D3Z0J0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa34D3Z0J0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa34D3Z0J0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa34D3Z0J0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms