Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc6D3YZP9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc6D3YZP9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc6D3YZP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc6D3YZP9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc6D3YZP9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc6D3YZP9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc6D3YZP9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc6D3YZP9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc6D3YZP9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc6D3YZP9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc6D3YZP9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms