Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ldlrad1D3YYZ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ldlrad1D3YYZ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ldlrad1D3YYZ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms