Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syce3B5KM66 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce3B5KM66 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Syce3B5KM66 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syce3B5KM66 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms