Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah3B2RWG3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms