Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AU015836B2RUM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU015836B2RUM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1574.7 ms