Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc22a28B2RT89 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a28B2RT89 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms