Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Uhrf1bp1B2KF50 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Uhrf1bp1B2KF50 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms