Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf25B1AWN9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tnfrsf25B1AWN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms