Protein–RNA interactions for Protein: A8DUK4

Hbb-bs, Beta-globin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bsA8DUK4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bsA8DUK4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bsA8DUK4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bsA8DUK4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms