Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Arid3cA6PWV5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Arid3cA6PWV5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Arid3cA6PWV5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Arid3cA6PWV5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Arid3cA6PWV5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms