Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6880A3KG45 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6880A3KG45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6880A3KG45 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6880A3KG45 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6880A3KG45 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6880A3KG45 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6880A3KG45 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6880A3KG45 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6880A3KG45 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6880A3KG45 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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