Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf39A2RT81 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf39A2RT81 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms