Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ism1A2ATD1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ism1A2ATD1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms