Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn1aA2APX8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn1aA2APX8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms