Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34dA2AGU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34dA2AGU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34dA2AGU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms