Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ckap5A2AGT5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ckap5A2AGT5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ckap5A2AGT5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap5A2AGT5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap5A2AGT5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ckap5A2AGT5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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