Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C87977A2A958 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C87977A2A958 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87977A2A958 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87977A2A958 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87977A2A958 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87977A2A958 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87977A2A958 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87977A2A958 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87977A2A958 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87977A2A958 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87977A2A958 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87977A2A958 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms