Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm6268A2A3U9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm6268A2A3U9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm6268A2A3U9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm6268A2A3U9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms