Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc112A0AUP1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc112A0AUP1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms