Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms