Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn3Q9Z0G9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms