Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms