Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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