Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp5Q9JKD3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms