Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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