Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms