Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fundc1Q9DB70 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fundc1Q9DB70 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms