Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrmuQ9DAT5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms