Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd9Q9D9M4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms