Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Clvs1Q9D4C9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clvs1Q9D4C9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Clvs1Q9D4C9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clvs1Q9D4C9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Clvs1Q9D4C9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Clvs1Q9D4C9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clvs1Q9D4C9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clvs1Q9D4C9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Clvs1Q9D4C9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clvs1Q9D4C9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms